El Fondo Hospital de Jesús se originó a través de los archivos administrativos del Marquesado del Valle y son el conjunto de documentos que dan testimonio sobre la administración, mercedes y privilegios que tuvo Hernán Cortés.

Cortés recibió del rey de España la merced territorial de 23 vasallos, el título de marqués del Valle de Oaxaca y merced política que lo nombraba capitán general de la Nueva España, incluyendo las provincias y costas del Mar del Sur.

Este fondo histórico resguarda quejas, pleitos judiciales que siguieron los habitantes del Marquesado del Valle contra administradores y dueños por constantes abusos; asimismo, existen documentos en lengua náhuatl sobre posesión y restitución de tierras a pueblos originarios.

El archivo es testimonio de la empresa que implementó Hernán Cortés a su llegada al territorio que posteriormente denominaría Nueva España.