Comprende un códice prehispánico y 92 códices coloniales originales, entre los que se pueden nombrar el Códice Colombino, Tira de la Peregrinación, Códice de la Cruz Badiano, Catecismo Gómez de Orozco, entre otros. La mayoría de estos documentos pictográficos se hicieron en el siglo XVI, unos pocos datan de los siglos XVII y XVIII. Los documentos pictográficos llamados «códices» son las únicas referencias que tenemos como fuentes originales de las culturas prehispánicas, de las primeras relaciones entre los pueblos nativos y los conquistadores españoles y son los únicos ejemplos sobrevivientes de un sistema de lectura y escritura peculiar de las culturas de Mesoamérica.